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乙型肝炎病毒耐藥基因檢測概述

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點擊次數(shù):1695 更新時間:2019年09月27日15:02:10 打印此頁 關(guān)閉
一、乙型肝炎病毒耐藥基因檢測的臨床意義
  WHO相關(guān)資料顯示,全球感染過乙型肝炎病毒(HBV)的患者超過三分之一,而慢性乙型肝炎患者約有2.4億,乙肝嚴重影響著人類的生命健康。HBV是傳染性疾病乙型病毒性肝炎的主要病因,感染HBV可引起肝硬化甚至肝細胞癌變。HBV屬嗜肝DNA病毒科,為雙鏈DNA病毒,容易發(fā)生變異,從而形成不同的基因型。目前已根據(jù)HBV核苷酸序列異質(zhì)性≥8%將其分成A-J 10種基因型[1-2]。在我國北方以C型為主,南方以B型為主,新疆有出現(xiàn)D型。作為常規(guī)抗病毒治療的核苷(酸)類似藥物,拉米夫定(LAM)和阿德福韋酯(ADV)等能夠有效抑制HBV的復(fù)制,然而長期使用會導(dǎo)致耐藥的發(fā)生,使治療效果明顯下降。隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展,越來越多的分子生物學(xué)技術(shù)用于HBV的基因分析,從而為乙肝患者的抗病毒治療提供科學(xué)的依據(jù)。盡早檢測HBV變異,準確判斷拉米夫定和阿德福韋酯等治療后耐藥,指導(dǎo)個性化用藥,對于提高乙肝治療成功率具有很重要的價值。
  二、乙型肝炎病毒耐藥機制以及常見的突變基因位點
  HBV基因型耐藥是指乙肝病毒出現(xiàn)某種特定的突變,這些特定的突變點導(dǎo)致HBV耐藥。其分子機制是:HBV是一種變異較高的病毒,在復(fù)制過程必須經(jīng)過RNA中間體的逆轉(zhuǎn)錄復(fù)制步驟,但RNA聚合酶和逆轉(zhuǎn)錄酶缺乏校正功能,因此在宿主免疫壓力和抗病毒藥物的選擇壓力下,其核酸在少數(shù)位點上發(fā)生突變是一種常見現(xiàn)象。
  HBV對核苷(酸)類似物耐藥的產(chǎn)生與HBV聚合酶基因變異有關(guān),并且HBV聚合酶基因變異是多位點的,以C區(qū)YMDD(酪氨酸-蛋氨酸-天冬氨酸-天冬氨酸)基序的變異最為重要。拉米夫定(LAM)的主要耐藥位點位于C區(qū)(rtM204V/I),204位點的蛋氨酸被纈氨酸(V)或異亮氨酸(I)置換,即rtM204V/I。上述突變直接導(dǎo)致病毒對藥物的敏感性降低,被稱為原發(fā)耐藥突變。另外部分突變不直接引起病毒對藥物敏感性的下降,但可以恢復(fù)原發(fā)耐藥變異病毒受損的復(fù)制力,被稱為補償耐藥突變,主要有rtV173L、rtL180M(常與rtM204V共同出現(xiàn))和rtL80I(常與rtM204I共同出現(xiàn))[3]。比如,HBV雙點突變株如rtM204V/rtL180M,其病毒復(fù)制能力強于rtM204I的單點突變株,可能與rtL180M(B區(qū))的變異補償C區(qū)YMDD變異株的復(fù)制缺陷有關(guān)。而另一種代表藥物阿德福韋酯(ADV),其耐藥變異位點則主要集中于HBV聚合酶基因B區(qū)rtA181T和D區(qū)rtN236T位點。
  三、乙型肝炎病毒耐藥基因檢測方法[4-6]
  1.PCR產(chǎn)物直接測序:是將HBV基因組的逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)進行擴增后直接進行測序分析的方法。PCR產(chǎn)物直接測序法可檢測已知和可能的未知耐藥變異位點,是最常用的基因型耐藥檢測方法之一。PCR產(chǎn)物直接測序的方法一般作為基因型耐藥檢測的金標準。該方法的缺點是靈敏性較差,只有當變異株超過HBV準種池的20%時才能被發(fā)現(xiàn)。
  2.聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP):該方法具有較強的靈敏性,可檢測數(shù)量占HBV準種池5%的耐藥變異株。但是PCR-RFLP只能檢測已知、單一位點的變異,對于少數(shù)耐藥變異位點監(jiān)測不失為一種簡便、快速且廉價的方法。但隨著多種核苷(酸)類似物的相繼問世和HBV耐藥變異位點的不斷出現(xiàn),該方法將難以勝任多位點變異的檢測。
  3.反向雜交法:基于該技術(shù)的INNO-LiPA方法在國外已獲準應(yīng)用于臨床檢測,目前INNO-LiPA HBV DR v3 可檢測包括拉米夫定(LAM)、替比夫定(LdT)、恩替卡韋(ETV)與阿德福韋酯(ADV)常見耐藥位點。該法可檢測變異株占HBV準種池5% ~ 10%的樣品,故敏感性較好,但其同樣只能檢測已知位點變異。
  4.實時熒光PCR:該方法操作簡便,可檢測變異發(fā)生率低于10%的耐藥變異。僅能檢測已知位點。
  5.基因芯片:亦稱DNA芯片、DNA微陣列,可檢測已知變異位點。
  6.限制性片段質(zhì)譜多態(tài)性技術(shù):該技術(shù)是將PCR-RFLP技術(shù)與基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù)結(jié)合,靈敏度高,能夠發(fā)現(xiàn)數(shù)量不足HBV準種池1%的變異株,但其同樣僅能檢測已知位點變異,且價格昂貴,很難在臨床推廣應(yīng)用。
  四、目前已上市產(chǎn)品介紹
  我國已批準上市的乙型肝炎病毒耐藥基因檢測試劑盒較多采用熒光PCR法,主要為國產(chǎn)產(chǎn)品,針對的基因突變位點主要是204位點的YMDD→YIDD(550ATG→ATT及550ATG→ATC)與YMDD→YVDD(550ATG→GTG)。還有較少產(chǎn)品能夠檢測發(fā)生在180位點(rtL180M)的基因突變。
  五、小結(jié)
  由于肝細胞中的共價環(huán)狀閉合DNA持續(xù)存在,使得乙肝患者需要長期用藥治療??笻BV核苷(酸)類藥物主要有拉米夫定(LAM)、替比夫定(LdT)、恩替卡韋(ETV)、阿德福韋酯(ADV)和富馬酸替諾福韋酯(TDF),其中前4種已在我國上市。長期使用核苷(酸)類似藥物不可避免地導(dǎo)致耐藥基因突變,最終病毒恢復(fù)復(fù)制能力,病情反彈。盡早進行乙肝病毒耐藥基因突變的檢測,可以及時發(fā)現(xiàn)病毒的耐藥情況,指導(dǎo)醫(yī)生合理用藥。隨著生物檢測技術(shù)的發(fā)展,越來越多的突變位點被發(fā)現(xiàn),為此類產(chǎn)品的技術(shù)審評帶來挑戰(zhàn)。
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